Когда в JSF managed bean внедряется зависимость в виде другого managed bean - это указывается или с помощью аннотаций, или в файле managed-beans.xml. В JSF 2 рекомендуется использовать аннотации, и мне тоже кажется что это более удобный подход - отпадает небходимость в еще одном XML файле настроек, аннотации это наглядно - все сразу видно при просмотре исходного кода класса.